Veľká Fatra patrí medzi najrozsiahlejšie a najtypickejšie jadrové pohoria Slovenska, kde sa zachovalo mnohotvárne a málo narušené prírodné prostredie.
Reliéf Veľkej Fatry je značne členitý pri veľkom výškovom rozpätí. Tento výškový gradient ju radí medzi vysoké hornatiny Slovenska. Medzi vzácne rastlinné spoločenstvá patria zvyšky reliktných borín na vápencových bralách.
Na území Veľkej Fatry prevažujú horské druhy živočíchov. Dosiaľ v nej bolo zistených okolo 110 druhov hniezdiacich vtákov a 60 druhov cicavcov. Zo šeliem možno spomenúť medveďa, rysa a vlka. Hniezdi tu orol skalný.
Z dôvodu ochrany prírody bol na území Veľkej Fatry vyhlásený národný park. Veľká Fatra spolu s priľahlými kotlinami prekypuje bohatstvom podzemných vôd, z ktorých mnohé pramene sa aj využívajú.